大明朝廷接到天津卫失陷的消息时，征讨海寇军队的统帅还没确定下来。天津卫有6000守军，有坚城大炮，却这么快就失陷了，连天津卫指挥守备刘毅也战死了，这使得朝廷群臣都吃惊不小。
自称“中华军”的台湾海寇已经攻占天津卫，随后乘着明军溃散，又占领了武清县；同时，中华军夺占了天津卫明军骑兵的大量马匹，海寇骑兵的游骑已经出现在了京师郊外了。在东北方向，沿海各盐场的防海兵丁全部溃散，由大沽口边白河口一直到大辛店已经完全空虚了，中华军水手火枪队的小股侦查部队出现在了大辛店。
在西南方向，中华军几支小部队已经在静海县外围活动，漕运船只大批地在山东、天津卫交界处拥堵起来。而中华军由于得到了天津卫存储的大量粮食，减缓了后勤压力，还能分出余粮赈济灾民、收买人心。明军的火药库也没来得及破坏，虽然明军火药质量差，不过用来做手雷还是可以的。
在这种危机情况下，朝廷上下总算暂时抛开了党争内讧，将时任左侍郎兼右佥都御史、总督蓟辽、保定的汪可受任命为主帅、天津经略，统领全部京军和勤王边兵反击中华军。
王恪守，字以虚，号静峰、三盘居士，是湖北黄梅独山汪革人。师从石昆玉、李贽。万历八年，中庚辰科进士三甲第五十六名。他后任兵部右侍郎，升左侍郎兼右佥都御史、蓟辽总督。
在天津卫陷落后第十天，在朝廷终于定下心要对付中华军北线部队时，南方传来的一则消息差一点使群臣不相信自己的耳朵。
“台湾海寇千余战船沿长江逆流而上，占领崇明、镇江，已经包围了南京。”
南北两京同时遭到中华军“海寇”的威胁，这是历朝历代从来没有过的事。
万历四十五年的战争，是有史以来旷古未有的战争形势：由大海上向内陆进攻、由东往西攻击，战争的一方有着水上便利的交通条件，机动能力超群；而另一方空守着广大内陆，却在沿海一带处处被动。
……
李星第三师全部、麦德第二师的一个团，炮兵旅的两个团，台湾土著辅助部队，还有吕宋邦邦牙土著营、海南黎民营，总计25000多名步军战士以及他们的武器装备，所搭乘的运输船足足有三百多艘。再包括军火粮草运输船队，水军护航舰船，浩浩荡荡的南线中华军船队足足有500多艘大型帆船，在半个月时间内从台湾到达了浙江沿海。这个时代，可以说也只有中华军有这个能力能够聚集齐500多艘大型帆船，统筹安排去执行一次作战行动。尹峰虽然算是南线总管，但是主要日常事务都是徐鸿基、曾山、李星、叶华等几人在负责。
现在在台湾、吕宋、琉球、南洋殖民地以及关岛，只有各地守备队、庄丁队在防守，步军机动部队只有赵宣明的南洋旅以及海南岛上的海南旅，即使加上留守台湾的麦德第二师两个团，也不到20000人，很多还是新兵。还好，水军第三舰队的主力全部都在南洋游弋，没有一艘船被抽调出来。
浙江沿海舟山群岛定海中左所，如今已经是中华联合公司定海港所在地了。大批各式帆船聚集在此，为南北两线作战部队转运物资。舟山群岛以南的钱昌所、爵溪所、石浦前所、石浦后所、昌国卫等明军所属的海岛卫所基地，已经全部被中华军控制；浙江沿海成千上万的渔民、前海盗、走私商群起而动，在舟山群岛形成了一处繁荣茂盛的交易市场。同时，中华军水军也在昌国卫、定海树旗招兵，为水军招到了不少熟练的水手。
在北线陈衷纪部队登陆蓬莱城的第三天，中华军水军舰队在最新的远字号主力战舰“威远”号带领下，以四艘飞字号压阵，三十五艘三桅炮舰、数百艘快船、巡逻船等蜂拥进入长江口，突然袭击并且一举攻占了崇明卫城和崇明县。随即在第二天，崇明岛对岸的吴淞所明军官兵弃城而走，中华军台湾舰队-第二舰队的一哨水手火枪队毫不费力占据了吴淞所。
虽然这个时代崇明岛还是个小岛，长江泥沙冲积情况也不太严重，但是长江水道只有中心航道适宜中华军的巨舰行驶，沿岸的水道不适合远字号、飞字号主力舰的行动。因此占据崇明岛后，中华军以缴获和临时改建的平底沙船型帆船为运输船队，以三桅福船为炮击舰队主力。
逆流而上的中华军击破沿江各路明军水师的阻击，将长江沿岸的明军水师战船几乎全数击沉、击毁或缴获。明军在长江沿线只有用单桅渔船改装的战船，配置的火器最多是小型佛郎机铳，在中华军水军炮舰的舰载加农炮和霹雳火箭密集的轰击下，明军水师根本连还手之力都没有。中华军主力部队十天后在镇江的长江沿岸登陆，水手火枪队十个哨队1000人排列出五列轮射阵型，用连绵的燧发火枪火力硬是将镇江卫5000名明朝官军的冲击阻止在滩头阵地上。
5000明军得到太仓、镇海赶来的4000名明军士兵增援，再次对1000名水手在镇江桥头的阵地发起攻击。已经成功登陆的李魁奇炮兵团五十门开花榴弹炮，以及长江上几十艘炮舰的上百门大炮一齐来了一次炮火覆盖，上百枚霹雳火箭用火箭车发射，拖着长长的白烟尾巴落在了明军阵地。
明军从来没有见识过如此猛烈的炮击，被炸得死伤遍地，长江岸边血流成河，残肢断体四处飞舞。明朝官军部队立刻彻底崩溃，乱纷纷地往南京城逃跑，连镇江城也弃之不顾了。
镇江陷落后，没过两天，扬州城也遭到了中华军的攻击。
在最新式的炮兵观测热气球升空后，李魁奇用十门攻城臼炮发射五十斤的爆炸开花弹和一百斤左右的实心铁弹，连续不断轰击扬州城墙。热气球的毛病就是怕风及不能耐久；这年头尹峰没法搞出什么高压煤气喷射加热的技术，只能是用人力鼓风机加炭火盆加热空气，使热气球上升，只小半个时辰气球就会失去浮力降下来，需要重新加热才行。因此精确炮击断断续续持续了一整天，终于在围攻扬州城的第二天，中华军炮兵硬生生把扬州城墙东门附近打出了一道五丈宽的缺口。
中华军并不急着往上冲，而是在炮兵观测气球的指导下，调用三十门轻型野战炮抵近城墙200步处发射开花弹，将急着上前堵缺口的明军炸死了一大片，然后用轰天雷臼炮抛射五十斤重炸药包（内含铁砂石块），将缺口后方的明军一堆堆地炸死。
热气球上的观测员拿着望远镜不断摇头，挥舞着信号旗向下面打着信号：“停火，没人了。”
缺口附近确实没活人了，几百具血肉模糊的尸体横七竖八到处躺着，周围明军士兵正在溃逃。中华军步军这才大摇大摆通过了缺口，进入扬州城，几乎毫无伤亡地占领了扬州，俘虏了几千名精神处于崩溃状态的明军溃兵。
镇江、扬州两大重镇失陷，南京已经门户大开了。
中华军犀利的火器至此已经威震天下，震慑住了所有的明军官兵部队。
中华军水手火枪队循着江南四通八达的水道开始向南推进。中华军在江南一带兵锋所指，明军的防御土崩瓦解。水手火枪队台湾总队主管是叶华南线舰队指挥官叶华兼任，他有一个侄儿叫叶鹰，带着仅仅一个队十二名水手火枪队员，大咧咧地来到了太仓城下“侦查”。他们向城头放了几枪，原本打算就此完成任务，回吴淞口的驻地了。结果，这几声枪响导致了太仓卫明军数千人炸了营；这些官兵刚刚从镇江逃回，对中华军火器威力心有余悸，成了惊弓之鸟。一半的明军士兵逃跑了，另一半明军开城向十二名中华军水手陆战队员投降。
叶鹰有点傻乎乎地接受了千余明军士兵的投降，他的十一名手下也是惊喜交加，可能吃惊的成分更多一点。幸好，另一队20名水手火枪队员划着舢板路过这里，帮助他们接收了太仓城。
在北线陈衷纪、范涛所部包围了天津卫的同时，中华军步军25000人全体在镇江登陆，向南京应天府进军。
江南一带群情惶惶不安，这一带文化发达、商业繁荣、各种消息流通的很快。苏浙一带官绅士人，大多数都已经看过了中华军发布的“七大恨”和“六大誓约”，虽然人人都表面上大骂中华军大逆不道、目无君父、毁灭人伦，但是一些人的内心深处却在想：商人，或者一般老百姓，他们能和皇帝讲条件，俨然平起平坐，真的就不可能吗？无罪就不该被无故抓、受罚，这难道不是理所当然的吗？海外子民难道就不是大明的百姓了？……
传统的力量很强大，但因为传统文化的封闭性，也就经不起严酷现实的打击。中华军喊着四民平等、开海禁、通商业的口号，显示出来的强大武力，多少有点砸痛了那些鼠目寸光的官绅士子们。不过，总得说来，中华军的**诉求，除了一部分商人和普通百姓外，并没有得到多少响应。
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